ACTIVATEUR : Activateur est un facteur transcriptionnel qui augmente l'activité transcriptionnelle.

APPAREILS: Les appareils sont un groupe de parties biologiques assemblées afin de répliquer une fonction biologique.

APTAMERE: Les aptamères sont des oligonucléotides ou peptides qui se lient à une molécule-cible spécifique.

BACTERIOPHAGE: Un bactériophage est un virus modifié, dans lequel un fragment d’adn d’intérêt est inséré, et qui porte l’adn d’intérêt à la cellule hôte.

BIOSENSEUR: Un biosenseur est un appareil qui utilise un organisme vivant ou des molécules organiques, surtout les enzymes ou les anticorps, afin de détecter la présence de substances chimiques.

BIOTECHNOLOGIE: La technologie des processus biologiques utilisant des organismes, principalement microorganismes, des parties et des produits de leur transformation tels que des enzymes, métabolites secondaires et anticorps, pour la production de produits utiles ou viables commercialement et pour ’approvisionnement de services bénéfiques au service des humains.

BISTABILITE: La bistabilité peut se produire dans des systèmes avec une variable à état unique and se réfère à la propriété d’avoir deux points stables d’équilibre.

CARACTERISATION: La caractérisation des composantes est un principe d’ingénierie qui concerne la mesure et le calcul des paramètres des composantes, afin qu’ils puissent être utilisés de manière fiable lors de l’assemblage d’un appareil. Modularité, caractérisation, et standardisation sont des principes d’ingénierie qui sont nécessaires à l’application de méthodes systématiques à la conception de systèmes biologiques.

COURBE DE CARLSON: Les courbes de Carlson illustrent la réduction dramatique des coûts et l’augmentation en performance dans une variété de technologies, telles que le séquençage de l’ADN, la composition de l’ADN ainsi que dans une série d’outils naturels et calcul.

CELLULE ARTIFICIELLE: Une cellule artificielle est une simili-cellule synthétisée qui mimique des fonctions biologiques normales telles que la réplication et l’évolution tout en étant capable de métaboliser des petits nutriments.

SYSTEMES SANS CELLULES: Un système sans cellules est un outil très utilisé pour étudier des réactions biochimiques in vitro dans des cellules non vivantes, réduisant ainsi les interactions complexes que l’on retrouve typiquement lorsqu’on travaille avec des vraies cellules vivantes.

CELLULES RECEPTEUR ANTIGENIQUE CHIMERIQUE T: Les cellules CAR-T sont des cellules immunitaires avec des récepteurs conçus qui déterminent à quels antigènes ces cellules répondent. Les récepteurs antigénique chimériques se trouvent sur la membrane de la cellule T.

CHASSIS: En biologie synthétique, un châssis fait référence à un cadre biologique réutilisable, un organisme, qui peut héberger and supporter des parties et composantes biologiques étrangères en fournissant les ressources nécessaires pour leur fonctionnement.

PROTEINES CHIMERIQUES: Les protéines chimériques sont des protéines résultant de la fusion des séquences de codante de gènes exprimant différentes protéines. Elles sont conçues pour combiner les fonctions des deux gènes combinés. Combiner des protéines fluorescentes comme GFP ou YFP avec d’autres protéines afin de visualiser leur expression est une pratique commune dans les laboratoires de biologie synthétique.

CLONAGE: Le clonage est le processus de production d’organismes individuels avec des ADN identiques ou quasiment identiques, de manière naturelle ou artificielle.

INTEROPERABILITE DES COMPOSANTES: L’interopérabilité des composantes est la capacité de la composante à opérer avec succès en conjonction avec d’autres composantes, sans limitations ou difficultés.

BIOLOGIE COMPUTATIONNELLE: La biologies computationnelles est la science de l’utilisation des ordinateurs et de méthodes informatiques pour étudier, modéliser and comprendre des systèmes et fonctions biologiques.

TECHNOLOGIE CRISPR CAS9: CRISPR-CAS9 est une technologie de modification de gène qui permet aux chercheurs de modifier de manière aisée des fonctions génétiques en remplaçant, modifiant, ou en les neutralisant. En 2020, emmanuelle charpentier et jennifer doudna ont rçu le pris nobel en chimie pour leurs travaux sur cette technologie.

CYCLE DBTL : Un cycle DBTL est un cycle fondamental utilisé par les ingénieurs dans l’application d’une idée innovante et consiste en les principes “conception, fabrication, test, apprentissage”.

DESIGN MODEL: Le modèle de conception est un modèle objet décrivant la réalisation des cas d'utilisation et sert d'abstraction du modèle de mise en œuvre et de son code source.

FEEDBACK LOOPS: Une boucle de rétroaction est la partie d'un système dans laquelle une partie (ou la totalité) de la sortie du système est utilisée comme entrée pour les opérations futures.

FORWARD ENGINEERING OU INGENIERIE PREVISIONNELLE: L'ingénierie prévisionnelle est le processus qui consiste à construire / ajouter des caractéristiques et des détails spécifiques à une partie d'un système de haut niveau sur la base de l'analyse de sa fonction.

GENE: Un gène est un séquence d’adn qui peut être transcrite en molécules d’ARN et induire la production de peptides. C’est l’unité d’hérédité de base de tous les organismes vivants.

CASSETTE GENETIQUE: La cassette génétique est une séquence d'ADN qui contient généralement un gène et qui a la capacité de se déplacer par recombinaison.

CIRCUIT GENETIQUE: Le circuit génétique est un ensemble de parties génétiques, à partir desquelles des molécules d'ARN et/ou des protéines sont exprimées, et qui permettent aux cellules de réaliser des fonctions spécifiques.

OGM OU ORGANISME GENETIQUEMENT ORGANISM: Un organisme génétiquement modifié est un organisme dont le matériel génétique a été modifié par des techniques de génie génétique.

GENOME MINIMAL: Le génome minimal est l'ensemble des éléments génétiques qui sont suffisants pour construire un organisme vivant.

MODELISATION DES SYSTEMES BIOLOGIQUES: Une boucle de rétroaction est la partie d'un système dans laquelle une partie (ou la totalité) de la sortie du système est utilisée comme entrée pour les opérations futures.

MODULARITE: La modularité est l'étude des différents composants d'un système.

NORMALISATION: La normalisation est un principe d'ingénierie qui implique la conception de pièces pouvant être combinées, facilement et de manière répétée, pour créer un dispositif, ce qui permet d'assembler ces pièces standard à chaque fois qu'un dispositif doit être créé, sans avoir à le produire à partir de zéro. La Modularité, la Caractérisation et la Normalisation sont des principes d'ingénierie qui sont nécessaires à l'application de méthodes systématiques à la conception de systèmes biologiques.

ORF (Open Reading Frames): Les cadres de lecture ouverts sont définis comme des séquences d'ADN situées entre les codons de départ et d'arrivée.

ORTHOGONALITE: L'orthogonalité est l'incapacité des éléments individuels d'un système biologique à interagir les uns avec les autres d'une manière qui modifie leur fonction souhaitée.

OSCILLATEUR: Circuits génétiques contenant trois gènes ou plus capables d'interagir les uns avec les autres de manière à ce que la sortie ou le signal soit modifié entre deux états. Cela se produit généralement lorsque le nombre de nœuds de ces réseaux synthétiques est impair.

PARTIE: Une partie est une région de l'ADN qui code pour une fonction biologique.

PCR ( Polymerase Chain Reaction): L'amplification en chaîne par polymérisation (PCR) est une technique de laboratoire permettant de produire (amplifier) rapidement des millions ou des milliards de copies d'un segment spécifique d'ADN, qui peut ensuite être étudié plus en détail.

PROMOTEUR: Un promoteur est une séquence d'ADN, située dans la partie supérieure d'un gène, où se fixent des protéines et des enzymes (facteurs de transcription et ARN polymérases), initiant ainsi la transcription de ce gène, qui donne naissance à une nouvelle molécule d'ARN.

PROTOCELLULES: Une protocellule est une collection sphérique auto-organisée, ordonnée de manière endogène, de composants abiotiques tels que les lipides, ayant la structure et les fonctions appropriées nécessaires à l'accomplissement des critères de base de la vie qui est proposée comme première étape vers l'origine de la vie.

PORTE LOGIQUE: Une porte logique est un dispositif idéalisé ou physique effectuant une opération logique sur une ou plusieurs entrées binaires et produisant une seule sortie binaire.

DETECTION DU QUORUM: La détection du quorum est la régulation de l'expression génétique en réponse aux fluctuations de la densité de la population cellulaire.

RETROINGENIERE: La rétro ingénierie est la reproduction du produit d'un autre fabricant après un examen détaillé de sa construction ou de sa composition.

REPRESSEUR: En génétique moléculaire, un répresseur est une protéine se liant à l'ADN ou à l'ARN qui inhibe l'expression d'un ou plusieurs gènes en se liant à l'opérateur ou aux silencieux associés.

RIBOSOME BINDING SITE (RBS): Segment d'ARNm auquel un ribosome peut se lier, initiant ainsi le processus de traduction du code de l'ARNm en protéine.

RIBOSWITCH: Segment d'ARNm qui change d'agencement grâce à la présence d'une substance particulière, régulant ainsi l'expression du gène d'intérêt (GOI).

ORDINATEUR RASPBERRY PI: Le Raspberry Pi est un ordinateur compact et peu coûteux qui peut être connecté à n'importe quel appareil comme un ordinateur ordinaire.

ASSEMBLAGE DE SEQUENCES: L'assemblage de séquences consiste à aligner et à fusionner des fragments issus d'une séquence d'ADN plus longue afin de reconstruire la séquence originale.

ANALYSE DE SENSIBILITE: L'analyse de sensibilité détermine comment différentes valeurs d'une variable indépendante peuvent affecter une variable dépendante particulière sous un ensemble donné d'hypothèses. Cette technique est utilisée dans des limites spécifiques qui dépendent d'une ou plusieurs variables d'entrée.

BIOLOGIE SYNTHETIQUE: La biologie synthétique est un domaine scientifique pluridisciplinaire qui consiste à redessiner des organismes à des fins utiles en les dotant de nouvelles capacités par la création de nouveaux éléments, dispositifs et systèmes biologiques.

SYSTEME: Un système est un réseau complexe qui relie entre elles plusieurs entités biologiquement pertinentes, appelées appareils, dans le but de créer une fonction biologique spécifique d'ordre supérieur.

BIOLOGIE SYSTEMIQUE: La biologie systémique est l'analyse et la modélisation computationnelle et mathématique de systèmes biologiques complexes.

SEQUENCES DE TERMINAISON DE LA TRANSCRIPTION: Les séquences de terminaison de la transcription sont des segments de séquences d'acide nucléique qui marquent la fin d'un gène ou d'un opéron dans l'ADN génomique pendant la transcription.

TRANSFECTION: La transfection est l'introduction d'un ADN exogène dans une cellule eucaryote.

TRANSFORMATION: En biologie, la transformation est l'un des nombreux processus par lesquels du matériel génétique sous forme d'ADN "nu" est transféré entre des cellules microbiennes.

TRANSGENIQUE: Un organisme transgénique est un organisme auquel un gène a été transféré à partir d'un organisme et/ou d'une espèce différente.

VIRUS: Un virus est un agent d'information génétique (ADN ou ARN).

VECTEUR: Un vecteur est une molécule utilisée comme véhicule pour transporter l'ADN (ou l'ARN) dans des cellules étrangères, procaryotes ou eucaryotes. Les plasmides sont les vecteurs les plus couramment utilisés dans les laboratoires de biologie synthétique.